More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1076 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
444 aa  885    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0571583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.89 
 
 
445 aa  606  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.606016 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.44 
 
 
474 aa  344  2e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.114503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.04 
 
 
460 aa  340  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 
485 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
463 aa  212  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.759845  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0718  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  28.92 
 
 
455 aa  202  9e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1074  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  29.47 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.07 
 
 
468 aa  201  3e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.64 
 
 
471 aa  178  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0657441  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.36 
 
 
472 aa  179  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.99842 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.32 
 
 
471 aa  173  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0283497 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
471 aa  170  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.03 
 
 
462 aa  145  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.548256  normal  0.2296 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.938775  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01330  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.08 
 
 
311 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  30.4 
 
 
279 aa  126  7e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
279 aa  126  7e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
399 aa  126  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.02594  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  30.84 
 
 
279 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
274 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.534309  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
364 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853093  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
325 aa  120  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3009  ABC transporter related  30.59 
 
 
314 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.450322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1482  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.45 
 
 
727 aa  116  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2578  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  27.69 
 
 
341 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
360 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.390668  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.22 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
818 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000335755  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0147  peptide ABC transporter, permease protein  26.86 
 
 
341 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.78 
 
 
273 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141415  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
309 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00634879  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03425  hypothetical protein  27.27 
 
 
341 aa  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002584  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 2  27.27 
 
 
341 aa  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  28.57 
 
 
289 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.960083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
314 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1400  ABC transporter related  28.7 
 
 
638 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785888  normal  0.726008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.51 
 
 
306 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.48 
 
 
340 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.705479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6186  ABC transporter related  29.96 
 
 
590 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 
319 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
292 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
331 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0878076  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.65 
 
 
276 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
344 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.08 
 
 
352 aa  107  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000439393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7446  ABC transporter, permease  27.15 
 
 
299 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913354  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.55 
 
 
371 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.55 
 
 
371 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0043  hypothetical protein  33.48 
 
 
269 aa  106  9e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.728589  normal  0.420247 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  30.04 
 
 
621 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.533008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
296 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
311 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
291 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.89 
 
 
336 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 
306 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  29.02 
 
 
479 aa  104  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  29.02 
 
 
473 aa  104  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3569  dipeptide ABC transporter, permease  31.11 
 
 
257 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2743  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
302 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.418739  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1930  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  31.11 
 
 
341 aa  103  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0488899  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.2 
 
 
330 aa  103  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0131606  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.15 
 
 
497 aa  103  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 
281 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0153047  normal  0.258787 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.02 
 
 
318 aa  103  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.91 
 
 
496 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 
426 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21760  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  28.38 
 
 
310 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0612673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4862  putative ABC transporter, permease protein  30.94 
 
 
327 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400673  normal  0.659782 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
290 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00106936  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
391 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3080  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.89 
 
 
283 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35224  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 
279 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0964586  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
309 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.031791  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
390 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2084  ABC transporter, permease  28.95 
 
 
293 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.741475 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
485 aa  101  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
277 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.486684  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
840 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
334 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.29 
 
 
347 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000434539  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  30.47 
 
 
304 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  30.47 
 
 
304 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3928  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  29.33 
 
 
394 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
349 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 
320 aa  100  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
285 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
299 aa  99.8  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
302 aa  99.8  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  0.031338 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
516 aa  99.8  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
390 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
348 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0562507  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
372 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.173212  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.25 
 
 
494 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
394 aa  99  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328727  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.42 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.697509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>