More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2230 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
450 aa  882    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.938775  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.77 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0718  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  29.89 
 
 
455 aa  201  3e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
472 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.99842 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
471 aa  187  4e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0283497 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
471 aa  186  6e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0657441  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
462 aa  182  9.000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.548256  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1074  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  29.32 
 
 
464 aa  180  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
485 aa  180  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
463 aa  173  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.759845  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.53 
 
 
460 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.51 
 
 
474 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.114503  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0571583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
279 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.06 
 
 
445 aa  127  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.606016 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
307 aa  122  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
305 aa  119  7.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01330  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.71 
 
 
311 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  29.51 
 
 
342 aa  116  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7446  ABC transporter, permease  32.09 
 
 
299 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913354  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
276 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.176316  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
281 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170759  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
302 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  0.031338 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.87 
 
 
289 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
318 aa  113  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2084  ABC transporter, permease  32.09 
 
 
293 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.741475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
340 aa  113  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.705479 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.79 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
299 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.73 
 
 
276 aa  111  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
310 aa  109  8.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
364 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853093  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 
274 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.534309  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 
325 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002584  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 2  28.51 
 
 
341 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3009  ABC transporter related  30.59 
 
 
314 aa  108  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.450322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 
303 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.576006 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
310 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1482  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.17 
 
 
727 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 
319 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2097  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  30.99 
 
 
298 aa  107  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
260 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000283157  unclonable  0.000000000020531 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
298 aa  107  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00686598  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1570  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  30.99 
 
 
298 aa  107  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 
282 aa  107  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.980051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
293 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.141846  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2172  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  30.99 
 
 
298 aa  106  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01443  D-ala-D-ala transporter subunit  30.99 
 
 
298 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.45304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01455  hypothetical protein  30.99 
 
 
298 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
818 aa  106  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000335755  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
279 aa  106  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1674  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  30.99 
 
 
298 aa  106  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03425  hypothetical protein  28.09 
 
 
341 aa  106  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.33 
 
 
280 aa  106  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489038  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
280 aa  106  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284624  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.49 
 
 
297 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405824  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  31.78 
 
 
621 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.533008  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  27.6 
 
 
279 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7556  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  30.62 
 
 
279 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  29.91 
 
 
283 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  29.63 
 
 
283 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  30.09 
 
 
283 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  29.91 
 
 
283 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
304 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.637669  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6674  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
282 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0258683  normal  0.60671 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.77 
 
 
277 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.44 
 
 
283 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
262 aa  105  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.452805  hitchhiker  0.000000299864 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.09 
 
 
283 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.6 
 
 
279 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 
283 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.46 
 
 
558 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00968979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
287 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 
304 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  28.51 
 
 
304 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2578  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  27.51 
 
 
341 aa  104  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
301 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1495  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
263 aa  104  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
311 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.732722 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1688  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  30.52 
 
 
298 aa  104  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.175944  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 
283 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.97 
 
 
283 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
300 aa  104  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
302 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  27.6 
 
 
279 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.46 
 
 
285 aa  103  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
360 aa  103  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.390668  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.46 
 
 
282 aa  103  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.951442  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 
318 aa  103  9e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.37 
 
 
533 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.822439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0643  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.96 
 
 
292 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7183  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  27.88 
 
 
335 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1563  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  28.79 
 
 
323 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3886  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  30.43 
 
 
301 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
301 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.37 
 
 
295 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>