More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1495 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1495  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
263 aa  512  1e-144  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.06 
 
 
262 aa  443  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.452805  hitchhiker  0.000000299864 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.92 
 
 
262 aa  410  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.24 
 
 
287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.24 
 
 
287 aa  265  7e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.83 
 
 
290 aa  260  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.287104  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.03 
 
 
286 aa  260  2e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.43 
 
 
291 aa  237  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0926789  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
298 aa  204  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 
299 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
287 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
295 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.57 
 
 
294 aa  195  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00097283 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.05 
 
 
296 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
299 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.51 
 
 
310 aa  192  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
289 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109416  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
293 aa  192  4e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.19302  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
305 aa  191  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
292 aa  188  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19595  decreased coverage  0.000508122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2848  ABC transporter permease protein  41.54 
 
 
276 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
304 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
296 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
309 aa  185  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  39.92 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
279 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
313 aa  182  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16510  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.32 
 
 
321 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.69344 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
292 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2680  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.33 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129024  normal  0.890863 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.47 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  37.74 
 
 
867 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 
341 aa  181  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
299 aa  181  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
299 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
299 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.553979  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1688  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  38.28 
 
 
298 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.175944  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
279 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01443  D-ala-D-ala transporter subunit  38.1 
 
 
298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.45304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01455  hypothetical protein  38.1 
 
 
298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2172  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  38.28 
 
 
298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1570  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  38.28 
 
 
298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1674  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  38.1 
 
 
298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2349  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  38.52 
 
 
295 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
292 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.771359  normal  0.585701 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.47 
 
 
280 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
292 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
298 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00686598  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  38.83 
 
 
317 aa  179  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
301 aa  179  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
310 aa  178  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5257  putative ABC transporter (permease protein)  38.7 
 
 
296 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216925  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
294 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
302 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2097  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  37.7 
 
 
298 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.69 
 
 
300 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
304 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
304 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
310 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362913 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  35.18 
 
 
279 aa  176  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
300 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
297 aa  175  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7518  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  34.73 
 
 
295 aa  175  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0791708  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5291  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  39.5 
 
 
282 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.61 
 
 
285 aa  175  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
307 aa  175  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 
277 aa  175  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.486684  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
294 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
285 aa  175  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
298 aa  175  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0407535  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4119  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  37.55 
 
 
282 aa  175  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
341 aa  175  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108082  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3133  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.37 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0620007  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1748  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  37.7 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.161109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.02 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.609485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3250  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC, putative  36.88 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  37.07 
 
 
300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
307 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
290 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0213  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  39.26 
 
 
389 aa  172  5.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  35.74 
 
 
304 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
296 aa  171  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
310 aa  171  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.33 
 
 
284 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1529  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.12 
 
 
302 aa  171  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
359 aa  171  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.61209  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0951  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
275 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24114  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5089  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  39.62 
 
 
293 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0927  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
284 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0968091  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1972  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.3 
 
 
262 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000233159  normal  0.641101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>