More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0421 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
262 aa  513  1e-144  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.46 
 
 
262 aa  430  1e-119  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.452805  hitchhiker  0.000000299864 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1495  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.92 
 
 
263 aa  416  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.13 
 
 
287 aa  291  6e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.13 
 
 
287 aa  291  9e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.99 
 
 
290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.287104  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.75 
 
 
286 aa  268  8.999999999999999e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.17 
 
 
291 aa  254  9e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0926789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
295 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
304 aa  208  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.23 
 
 
292 aa  208  9e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19595  decreased coverage  0.000508122 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
310 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
300 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.19 
 
 
294 aa  206  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00097283 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.36 
 
 
299 aa  204  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
298 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
287 aa  202  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.08 
 
 
299 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2848  ABC transporter permease protein  42.86 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109416  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
307 aa  199  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1688  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  40.47 
 
 
298 aa  198  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.175944  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1570  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  40.08 
 
 
298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2172  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  40.08 
 
 
298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01443  D-ala-D-ala transporter subunit  40.08 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.45304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01455  hypothetical protein  40.08 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1674  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  40.08 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  41.11 
 
 
867 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2097  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  39.69 
 
 
298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
298 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00686598  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 
295 aa  194  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.77 
 
 
293 aa  194  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.19302  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 
285 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2349  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  39.92 
 
 
295 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0951  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
275 aa  193  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24114  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16510  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.73 
 
 
321 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.69344 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
296 aa  192  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.56 
 
 
296 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
305 aa  191  8e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.63 
 
 
280 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41 
 
 
292 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41 
 
 
292 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.771359  normal  0.585701 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2052  oligopeptides ABC transporter permease protein  43.02 
 
 
290 aa  189  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
294 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1115  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  41.3 
 
 
300 aa  188  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.15 
 
 
359 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.61209  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4119  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  38.46 
 
 
282 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 
313 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.54 
 
 
300 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1748  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  38.91 
 
 
294 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.161109  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
301 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  37.93 
 
 
279 aa  185  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
301 aa  185  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.59 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0322  putative ABC transport system permease protein  40.64 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1850  ABC transporter permease  40.64 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1765  putative glutathione ABC transporter, permease protein  40.64 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  40.64 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1356  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  40.64 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.222916  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0399  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  40.64 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19947  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0241  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  40.64 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
294 aa  182  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2680  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.26 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129024  normal  0.890863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.31 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
309 aa  182  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41 
 
 
310 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362913 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2263  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.73 
 
 
296 aa  181  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
309 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
279 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
309 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.805329  normal  0.0512458 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  39.55 
 
 
317 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
299 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
297 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172272  normal  0.144154 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4060  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  39.85 
 
 
292 aa  179  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1865  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  38.49 
 
 
297 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 
293 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
296 aa  178  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
289 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133944  normal  0.758242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 
277 aa  178  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.486684  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0838  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  39.51 
 
 
301 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00766751  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
297 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
297 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723958 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 
300 aa  178  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.41 
 
 
285 aa  178  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 
291 aa  178  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.27 
 
 
263 aa  178  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.84 
 
 
285 aa  178  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  43.03 
 
 
282 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.04 
 
 
303 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.49 
 
 
293 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
301 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7518  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  36.78 
 
 
295 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0791708  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.84 
 
 
299 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111328  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  37.5 
 
 
304 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2115  peptide ABC transporter membrane protein  39.08 
 
 
286 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
300 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.0461956 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
304 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>