More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0388 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.51 
 
 
516 aa  970    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
516 aa  1039    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.87 
 
 
542 aa  568  1e-160  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000497228  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.37 
 
 
532 aa  528  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.180791  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.71 
 
 
558 aa  374  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00968979  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.4 
 
 
352 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000439393  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.65 
 
 
364 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853093  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.64 
 
 
360 aa  268  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.390668  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4163  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.8 
 
 
372 aa  266  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0546516  hitchhiker  0.0000167593 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.43 
 
 
371 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.43 
 
 
371 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.99 
 
 
363 aa  262  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.960083  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.18 
 
 
355 aa  262  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0423435  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.65 
 
 
376 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.24 
 
 
378 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0445  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems permease components-like  42.05 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.881548 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4032  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  51.6 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52 
 
 
367 aa  242  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.251856  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52 
 
 
367 aa  241  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000435882  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.13 
 
 
387 aa  237  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.219738 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1342  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.24 
 
 
380 aa  230  5e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.404079 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5517  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  44.36 
 
 
379 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.3 
 
 
426 aa  227  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5698  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  49.12 
 
 
387 aa  226  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.040975  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
396 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0964452  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
387 aa  225  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.26 
 
 
373 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.652162  normal  0.275677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14280  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.67 
 
 
384 aa  219  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.79 
 
 
368 aa  219  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.79 
 
 
368 aa  218  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 
391 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3928  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  41.27 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295297 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 
391 aa  213  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.73 
 
 
390 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
390 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  46.46 
 
 
307 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.53 
 
 
307 aa  211  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.82 
 
 
494 aa  210  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.46 
 
 
306 aa  210  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.46 
 
 
306 aa  210  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.46 
 
 
307 aa  210  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  45.58 
 
 
307 aa  210  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.38 
 
 
485 aa  209  7e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  45.58 
 
 
307 aa  209  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  45.58 
 
 
307 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
497 aa  209  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
375 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0268  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.46 
 
 
307 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
375 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.26 
 
 
496 aa  208  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  45.13 
 
 
307 aa  207  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  45.13 
 
 
307 aa  207  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.69 
 
 
495 aa  206  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.42 
 
 
373 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647572 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  42.74 
 
 
473 aa  204  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  44.83 
 
 
479 aa  204  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  44.69 
 
 
304 aa  204  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  44.69 
 
 
304 aa  204  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.72 
 
 
343 aa  204  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.29 
 
 
344 aa  203  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
316 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.96 
 
 
375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.69 
 
 
386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0112138  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.899475  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1706  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.85 
 
 
378 aa  200  5e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.46 
 
 
387 aa  199  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.257329  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.69 
 
 
386 aa  200  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195015  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5117  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  40.4 
 
 
373 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 
603 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.959889  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 
377 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.765762  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  45.22 
 
 
283 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  45.37 
 
 
283 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  45.37 
 
 
283 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  45.37 
 
 
283 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  45.37 
 
 
283 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  45.37 
 
 
283 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.18 
 
 
523 aa  196  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0690877  normal  0.267922 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  45.37 
 
 
283 aa  196  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
379 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.648846 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  45.37 
 
 
283 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.25 
 
 
462 aa  195  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211529  hitchhiker  0.00061128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.54 
 
 
283 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.75 
 
 
284 aa  193  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
280 aa  193  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.2 
 
 
280 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.13 
 
 
376 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135755  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  44.64 
 
 
282 aa  191  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 
317 aa  189  1e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
299 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5258  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.92 
 
 
392 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
349 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0337  oligopeptide transport system permease protein OppC  38.91 
 
 
349 aa  187  4e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0317514  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.41 
 
 
285 aa  186  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
330 aa  186  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.188792  normal  0.026678 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1274  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  39.74 
 
 
305 aa  185  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000176481  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.33 
 
 
658 aa  184  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0118989  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 
299 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
468 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>