More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5449 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.44 
 
 
373 aa  723    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.652162  normal  0.275677 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
373 aa  753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.68 
 
 
387 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.219738 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.11 
 
 
367 aa  413  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000435882  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.11 
 
 
367 aa  413  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.251856  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5698  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  56.67 
 
 
387 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.040975  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14280  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  52.2 
 
 
384 aa  388  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.02 
 
 
426 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5258  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.4 
 
 
392 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5517  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  49.61 
 
 
379 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.17 
 
 
368 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.72 
 
 
368 aa  380  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1706  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.57 
 
 
378 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.76 
 
 
396 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0964452  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.42 
 
 
391 aa  362  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.34 
 
 
376 aa  354  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135755  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.14 
 
 
391 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3928  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  47.75 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.1 
 
 
385 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295297 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.43 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.62 
 
 
390 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.21 
 
 
386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.07 
 
 
386 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195015  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.28 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.65 
 
 
387 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.257329  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.12 
 
 
360 aa  299  6e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.390668  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.32 
 
 
363 aa  293  5e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.960083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
375 aa  290  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.5 
 
 
364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853093  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.7 
 
 
376 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0112138  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
375 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.15 
 
 
376 aa  275  9e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.899475  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 
352 aa  272  7e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000439393  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
377 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.765762  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.43 
 
 
375 aa  255  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5117  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  38.35 
 
 
373 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
379 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.648846 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1342  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.404079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
355 aa  232  7.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0423435  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4163  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.61 
 
 
372 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0546516  hitchhiker  0.0000167593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
376 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.43 
 
 
371 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.43 
 
 
371 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
558 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00968979  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.42 
 
 
516 aa  222  9e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.73 
 
 
378 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0445  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems permease components-like  39.51 
 
 
351 aa  213  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.881548 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3158  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  34.33 
 
 
415 aa  210  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4032  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  36.68 
 
 
371 aa  209  7e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
532 aa  208  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.180791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.7 
 
 
516 aa  206  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.79 
 
 
494 aa  193  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.1 
 
 
307 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.56 
 
 
284 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
497 aa  188  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  43.81 
 
 
307 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.04 
 
 
307 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0268  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.81 
 
 
307 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  42.04 
 
 
307 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
307 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.36 
 
 
306 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.36 
 
 
306 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.74 
 
 
280 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.04 
 
 
307 aa  187  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  45.61 
 
 
288 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.73 
 
 
309 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.18 
 
 
280 aa  186  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  46.67 
 
 
282 aa  186  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  41.59 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  41.59 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
316 aa  184  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
496 aa  184  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.78 
 
 
285 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.67 
 
 
485 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
495 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.37 
 
 
354 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.844451  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
343 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.09 
 
 
274 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.49 
 
 
280 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
344 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  33.07 
 
 
479 aa  177  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  40.16 
 
 
473 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
542 aa  178  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000497228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
468 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.54 
 
 
278 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
285 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
349 aa  176  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.44 
 
 
284 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 
310 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 
310 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  45.74 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.77 
 
 
299 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
258 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.289806  normal  0.295413 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04845  oligopeptide ABC transporter permease  31.9 
 
 
368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279335  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1069  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  37.78 
 
 
338 aa  173  5e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.53 
 
 
299 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
340 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  40.17 
 
 
304 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>