More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0807 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
349 aa  698    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.17 
 
 
603 aa  291  8e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.959889  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.52 
 
 
468 aa  263  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44 
 
 
307 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  43.69 
 
 
307 aa  255  9e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.34 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  43.34 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  43.34 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  43.96 
 
 
307 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0268  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.96 
 
 
307 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.38 
 
 
306 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.34 
 
 
306 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.31 
 
 
307 aa  248  8e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 
307 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.76 
 
 
316 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  48.16 
 
 
304 aa  222  8e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  48.16 
 
 
304 aa  222  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
304 aa  209  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477815  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
323 aa  209  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.478272  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1069  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  41.38 
 
 
338 aa  207  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
299 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
299 aa  202  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.96 
 
 
494 aa  202  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 
496 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.62 
 
 
485 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  31.7 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
310 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
274 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
367 aa  199  6e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000435882  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.49 
 
 
284 aa  199  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 
360 aa  199  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.390668  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
293 aa  199  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  34.81 
 
 
473 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.251856  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.64 
 
 
497 aa  196  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
280 aa  196  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0445  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems permease components-like  45.38 
 
 
351 aa  195  9e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.881548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
280 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.82 
 
 
302 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
363 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.960083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  36.31 
 
 
284 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
376 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.32 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853093  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 
282 aa  190  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  34.8 
 
 
300 aa  189  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
350 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
300 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
319 aa  188  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.112458  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
390 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  34.29 
 
 
293 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.59 
 
 
285 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
347 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000434539  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 
352 aa  187  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000439393  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
313 aa  186  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0216916  hitchhiker  0.00872775 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
324 aa  186  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588573  decreased coverage  0.00594817 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
340 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1403  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  32.55 
 
 
373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
371 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
371 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  34.21 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295297 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
258 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.289806  normal  0.295413 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
376 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161422  normal  0.279284 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
305 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
343 aa  182  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
307 aa  182  7e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
310 aa  182  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
344 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  34.58 
 
 
288 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 
283 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0407  peptide ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 
302 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404999  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
542 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407034  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0755  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  32.22 
 
 
304 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
387 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.219738 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
391 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  34.4 
 
 
300 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1274  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  38.93 
 
 
305 aa  181  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000176481  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
278 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  41.18 
 
 
283 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
378 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
308 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 
296 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0104198  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0350  peptide ABC transporter, permease protein  33.97 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
327 aa  180  4e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000093135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  40.76 
 
 
283 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  40.76 
 
 
283 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1872  oligopeptide ABC transporter permease protein OppC  32.46 
 
 
302 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
310 aa  179  4.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  40.76 
 
 
283 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>