More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2364 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
330 aa  653    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.188792  normal  0.026678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.21 
 
 
334 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.36 
 
 
334 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.825229 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.01 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0216916  hitchhiker  0.00872775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.19 
 
 
323 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.478272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 
280 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
280 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
280 aa  222  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  42.19 
 
 
282 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.53 
 
 
284 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
285 aa  212  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  38.98 
 
 
304 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  38.98 
 
 
304 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
299 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
285 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  37.5 
 
 
288 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
312 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
299 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
485 aa  202  5e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
494 aa  202  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  35.24 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1822  oligopeptide transport integral membrane protein  37.46 
 
 
341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.661927  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
309 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.031791  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.74 
 
 
306 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  39.11 
 
 
479 aa  199  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.74 
 
 
306 aa  199  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.81 
 
 
307 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  38.49 
 
 
473 aa  198  9e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  35.81 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  37.42 
 
 
284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
497 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
495 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5301  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  36.62 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.527833  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5914  ABC transporter, permease protein  37.77 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  0.0354831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
349 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000439393  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
287 aa  196  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
300 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
296 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 
307 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.56 
 
 
300 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0445  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems permease components-like  41.09 
 
 
351 aa  195  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.881548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
341 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.969826  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
310 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  35.15 
 
 
308 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046213 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
348 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0562507  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
293 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  35.48 
 
 
307 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
293 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0854715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
344 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.48 
 
 
307 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0268  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 
307 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
307 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
343 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 
307 aa  192  5e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
361 aa  192  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
274 aa  192  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1851  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.24 
 
 
331 aa  192  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.737422 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  34.5 
 
 
299 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  34.5 
 
 
299 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  34.5 
 
 
299 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  35.12 
 
 
279 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 
285 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  34.5 
 
 
299 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.5 
 
 
299 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
258 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.289806  normal  0.295413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  35.26 
 
 
303 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  36.54 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
344 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
347 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000434539  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
304 aa  189  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
342 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
303 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  35.26 
 
 
303 aa  189  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  35.26 
 
 
303 aa  189  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  35.26 
 
 
303 aa  189  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  36.54 
 
 
300 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
300 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  35.26 
 
 
303 aa  189  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
311 aa  189  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.95 
 
 
303 aa  188  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
303 aa  188  9e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2848  ABC transporter permease protein  38.28 
 
 
276 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  34.95 
 
 
303 aa  188  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  37.5 
 
 
317 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
300 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.407507  hitchhiker  0.0072251 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
542 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407034  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  34.37 
 
 
293 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
304 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477815  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
367 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000435882  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.27 
 
 
288 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
336 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
376 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
303 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>