More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1803 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
387 aa  786    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.52 
 
 
375 aa  421  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.23 
 
 
376 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0112138  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.45 
 
 
376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.899475  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.49 
 
 
375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.77 
 
 
367 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000435882  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.5 
 
 
367 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.251856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.53 
 
 
387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.219738 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.19 
 
 
368 aa  339  5e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.19 
 
 
368 aa  339  5e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1706  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.67 
 
 
378 aa  334  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.12 
 
 
385 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295297 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5698  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  43.99 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.040975  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.3 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0964452  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.33 
 
 
376 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135755  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.28 
 
 
391 aa  315  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5517  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  42.3 
 
 
379 aa  312  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585071  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.652162  normal  0.275677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.26 
 
 
426 aa  296  4e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
391 aa  296  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 
390 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.31 
 
 
387 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.257329  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
390 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3928  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  38.58 
 
 
394 aa  290  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5258  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 
392 aa  290  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.28 
 
 
373 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.67 
 
 
386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 
352 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000439393  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 
363 aa  286  4e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.960083  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14280  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.74 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.4 
 
 
386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195015  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1342  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.3 
 
 
380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.404079 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.62 
 
 
364 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853093  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
360 aa  268  8e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.390668  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
355 aa  255  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0423435  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
371 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
371 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.09 
 
 
558 aa  247  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00968979  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4163  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.02 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0546516  hitchhiker  0.0000167593 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
377 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.765762  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
376 aa  242  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 
375 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
378 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
379 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.648846 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4032  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  37.96 
 
 
371 aa  231  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5117  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  36.78 
 
 
373 aa  229  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0445  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems permease components-like  39.8 
 
 
351 aa  223  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.881548 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
516 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
494 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
532 aa  207  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.180791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
516 aa  204  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
485 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
497 aa  196  8.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
496 aa  196  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
495 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3158  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  32.14 
 
 
415 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  31.43 
 
 
473 aa  193  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  33.51 
 
 
479 aa  191  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
307 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
307 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  43.17 
 
 
307 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.17 
 
 
306 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.17 
 
 
306 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
316 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0268  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.17 
 
 
307 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0337  oligopeptide transport system permease protein OppC  31.3 
 
 
349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0317514  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  43.17 
 
 
282 aa  182  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
542 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000497228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.85 
 
 
307 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  41.85 
 
 
307 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
258 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.289806  normal  0.295413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.41 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.17 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
376 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161422  normal  0.279284 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  40.97 
 
 
307 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  40.97 
 
 
307 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
349 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.48 
 
 
285 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.61 
 
 
302 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
285 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
304 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  39.47 
 
 
304 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
468 aa  176  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.85 
 
 
285 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.65 
 
 
280 aa  176  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
344 aa  176  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.65 
 
 
280 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1069  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  40.79 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  39.82 
 
 
310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.05 
 
 
300 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
284 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  37.4 
 
 
300 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
327 aa  171  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000093135  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  38.5 
 
 
302 aa  171  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1403  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  32.61 
 
 
373 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
299 aa  170  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 
361 aa  169  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
308 aa  169  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>