More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4163 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4163  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  100 
 
 
372 aa  734    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0546516  hitchhiker  0.0000167593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4032  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  81.45 
 
 
371 aa  591  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.31 
 
 
371 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.31 
 
 
371 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.19 
 
 
355 aa  545  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0423435  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.03 
 
 
378 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.73 
 
 
376 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0445  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems permease components-like  61.95 
 
 
351 aa  432  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.881548 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.7 
 
 
352 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000439393  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 
363 aa  278  9e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.960083  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 
364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853093  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
367 aa  273  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.251856  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000435882  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.76 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.390668  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5517  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  42.78 
 
 
379 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585071  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.58 
 
 
558 aa  263  4.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00968979  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3928  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  38.15 
 
 
394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.8 
 
 
516 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
385 aa  253  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295297 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
391 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
387 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.219738 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.54 
 
 
387 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.57 
 
 
390 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
390 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
391 aa  243  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.5 
 
 
532 aa  243  5e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.180791  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1342  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
380 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.404079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
386 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
386 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3376  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
396 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0964452  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.8 
 
 
516 aa  231  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14280  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.99 
 
 
384 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
373 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.652162  normal  0.275677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
387 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.257329  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
376 aa  229  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0112138  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
426 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.14 
 
 
368 aa  228  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
376 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.899475  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5698  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  38.36 
 
 
387 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.040975  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
368 aa  226  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.69 
 
 
376 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
375 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
494 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1706  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 
378 aa  216  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
496 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.84 
 
 
542 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000497228  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
495 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
379 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.648846 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5258  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
392 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
375 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.91 
 
 
485 aa  211  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  36.68 
 
 
479 aa  209  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5117  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  34.15 
 
 
373 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.41 
 
 
497 aa  209  6e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
375 aa  209  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  35.08 
 
 
473 aa  209  9e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
377 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.765762  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 
658 aa  202  6e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0118989  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
373 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647572 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  44.69 
 
 
304 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  44.69 
 
 
304 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 
603 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.959889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.98 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.67 
 
 
299 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.98 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  44.98 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.4 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.21 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.98 
 
 
306 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.98 
 
 
306 aa  196  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.74 
 
 
284 aa  195  9e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  44.54 
 
 
307 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  44.54 
 
 
307 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  44.54 
 
 
307 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0268  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.54 
 
 
307 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.36 
 
 
283 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.36 
 
 
283 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.92 
 
 
283 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.92 
 
 
283 aa  193  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  42.92 
 
 
283 aa  193  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  42.67 
 
 
288 aa  193  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.1 
 
 
307 aa  193  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  45.38 
 
 
317 aa  192  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.92 
 
 
283 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  42.92 
 
 
283 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  42.92 
 
 
283 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  42.92 
 
 
283 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 
293 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 
293 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0854715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  44 
 
 
282 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 
278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 
280 aa  189  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
468 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
285 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.67 
 
 
284 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
280 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.1 
 
 
296 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
309 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1069  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  41.85 
 
 
338 aa  186  4e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24260  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  42.34 
 
 
313 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>