60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3384 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  100 
 
 		 533 aa  1078    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  45.85 
 
 		 534 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  36.62 
 
 		 526 aa  290  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  32.38 
 
 		 516 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  26.48 
 
 		 520 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  30.36 
 
 		 318 aa  100  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  30.77 
 
 		 309 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  28.68 
 
 		 277 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0848  hypothetical protein  31.55 
 
 		 206 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  31.84 
 
 		 281 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  31.71 
 
 		 284 aa  97.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  32.68 
 
 		 281 aa  97.1  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  34.22 
 
 		 312 aa  93.2  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  28.69 
 
 		 290 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2198  EpsI family protein  28.02 
 
 		 210 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  22.69 
 
 		 510 aa  91.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  26.92 
 
 		 304 aa  89  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  29.46 
 
 		 277 aa  89  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1804  EpsI family protein  28.91 
 
 		 208 aa  88.6  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2446  EpsI family protein  30.69 
 
 		 208 aa  86.7  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  24.71 
 
 		 530 aa  86.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  30.4 
 
 		 298 aa  86.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  24.7 
 
 		 523 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  27.61 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  28.03 
 
 		 524 aa  84.3  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  28.85 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  31.22 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  28.17 
 
 		 515 aa  83.6  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  23.74 
 
 		 536 aa  82.8  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  25.93 
 
 		 514 aa  81.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  24.51 
 
 		 529 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  25.88 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  25.63 
 
 		 522 aa  80.1  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  24.74 
 
 		 528 aa  76.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0671  EpsI family protein  31.33 
 
 		 243 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  26.77 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  23.48 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3053  hypothetical protein  29.81 
 
 		 206 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2442  hypothetical protein  29.84 
 
 		 210 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  21.8 
 
 		 497 aa  69.3  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1978  hypothetical protein  25.82 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  34.53 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  23.68 
 
 		 516 aa  64.7  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  31.93 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0721  hypothetical protein  27.32 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.34975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  24.6 
 
 		 542 aa  60.5  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  24.14 
 
 		 525 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2341  hypothetical protein  22.37 
 
 		 217 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  22.3 
 
 		 508 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  24.61 
 
 		 476 aa  57  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  22.13 
 
 		 496 aa  56.6  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  24 
 
 		 492 aa  54.7  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  29.87 
 
 		 213 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3885  hypothetical protein  26.32 
 
 		 550 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.315929  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  26.32 
 
 		 291 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  26.52 
 
 		 462 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5285  hypothetical protein  25.56 
 
 		 293 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  23.97 
 
 		 485 aa  50.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2002  hypothetical protein  24.36 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  28.68 
 
 		 358 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>