40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2971 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  100 
 
 
485 aa  935    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  33.07 
 
 
510 aa  197  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  37.31 
 
 
514 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  35.79 
 
 
530 aa  172  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  33.45 
 
 
524 aa  171  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  31.4 
 
 
529 aa  168  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  33.56 
 
 
528 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  33.85 
 
 
505 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  28.91 
 
 
536 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  38.17 
 
 
523 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  33.22 
 
 
515 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  28.36 
 
 
476 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  34.83 
 
 
522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  28.45 
 
 
497 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  34.17 
 
 
492 aa  126  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  24.93 
 
 
520 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  29.2 
 
 
462 aa  69.7  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  26 
 
 
508 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  24.05 
 
 
526 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  27.98 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  24.15 
 
 
516 aa  67  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  26.77 
 
 
315 aa  65.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  23.88 
 
 
496 aa  63.9  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  25.9 
 
 
525 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  28.69 
 
 
281 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  25.33 
 
 
516 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  22.42 
 
 
533 aa  53.9  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  26.55 
 
 
331 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  23.81 
 
 
285 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  26.45 
 
 
281 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  22.71 
 
 
309 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  25.94 
 
 
295 aa  50.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  26.58 
 
 
298 aa  50.4  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  24.89 
 
 
281 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  27.52 
 
 
277 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  22.18 
 
 
534 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  24.71 
 
 
284 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  22.27 
 
 
277 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3885  hypothetical protein  33.75 
 
 
550 aa  44.3  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.315929  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  26.41 
 
 
312 aa  43.1  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>