56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1503 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  100 
 
 		 526 aa  1072    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  41.21 
 
 		 516 aa  425  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  36.62 
 
 		 533 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  31.25 
 
 		 534 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  28.77 
 
 		 520 aa  225  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  36.33 
 
 		 277 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  36.03 
 
 		 281 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  39.82 
 
 		 312 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  37.77 
 
 		 281 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  35.65 
 
 		 277 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  23.96 
 
 		 510 aa  124  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  33.85 
 
 		 309 aa  123  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  24.06 
 
 		 529 aa  121  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  25 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  30.9 
 
 		 285 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  26.67 
 
 		 530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  32.46 
 
 		 281 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  33.05 
 
 		 284 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  24.01 
 
 		 528 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2198  EpsI family protein  30.54 
 
 		 210 aa  107  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  24.65 
 
 		 524 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  31.9 
 
 		 505 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1804  EpsI family protein  30.73 
 
 		 208 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0848  hypothetical protein  33.01 
 
 		 206 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2446  EpsI family protein  32.07 
 
 		 208 aa  101  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  25.2 
 
 		 515 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  23.25 
 
 		 522 aa  99.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  28.03 
 
 		 295 aa  97.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2442  hypothetical protein  31.52 
 
 		 210 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  25.11 
 
 		 536 aa  96.3  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  26.43 
 
 		 315 aa  95.5  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  28.57 
 
 		 290 aa  94.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  20.46 
 
 		 476 aa  92.8  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  28.1 
 
 		 523 aa  90.1  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  21.98 
 
 		 497 aa  89.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  30.92 
 
 		 331 aa  87  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0671  EpsI family protein  29.12 
 
 		 243 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  28.33 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  28.9 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  27.45 
 
 		 304 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2341  hypothetical protein  24.04 
 
 		 217 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  30.65 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  26.03 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3053  hypothetical protein  27.42 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1978  hypothetical protein  27.23 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  28.17 
 
 		 542 aa  70.5  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  24.05 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  23.57 
 
 		 525 aa  66.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  30.58 
 
 		 213 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  20.08 
 
 		 496 aa  63.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3885  hypothetical protein  25.69 
 
 		 550 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.315929  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  25.33 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  25.3 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  24.44 
 
 		 516 aa  54.7  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  31.43 
 
 		 358 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2002  hypothetical protein  22.7 
 
 		 207 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>