45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0666 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  100 
 
 		 528 aa  1054    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  47.3 
 
 		 505 aa  452  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  45.08 
 
 		 536 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  42.02 
 
 		 529 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  44.06 
 
 		 515 aa  336  5.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  39.47 
 
 		 514 aa  327  5e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  39.76 
 
 		 530 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  40.91 
 
 		 524 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  36.02 
 
 		 510 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  30.3 
 
 		 523 aa  193  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  27.5 
 
 		 497 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  28.73 
 
 		 476 aa  187  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  33.8 
 
 		 485 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  36.76 
 
 		 522 aa  156  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  29.88 
 
 		 492 aa  153  7e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  23.01 
 
 		 496 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  24.86 
 
 		 526 aa  115  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  25.46 
 
 		 516 aa  114  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  26.42 
 
 		 508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  23.13 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  27.22 
 
 		 525 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  27.2 
 
 		 290 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  32.3 
 
 		 277 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  23.63 
 
 		 516 aa  94.4  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  28.77 
 
 		 309 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  30.53 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  27.24 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  24.74 
 
 		 533 aa  82.8  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  31.08 
 
 		 281 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  28.93 
 
 		 285 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  28.17 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  25.74 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  28.21 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  27.5 
 
 		 281 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  28.57 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  21.79 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  24.49 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  32.41 
 
 		 658 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  27.87 
 
 		 281 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  24.09 
 
 		 542 aa  53.9  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  29.9 
 
 		 358 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  26.34 
 
 		 298 aa  51.2  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2911  hypothetical protein  24.9 
 
 		 306 aa  50.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326024 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  26.03 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  23.68 
 
 		 298 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>