31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1624 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  100 
 
 
516 aa  1050    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  27.65 
 
 
508 aa  137  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  25.95 
 
 
496 aa  123  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  24.66 
 
 
497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  24.75 
 
 
525 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  28.52 
 
 
528 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  34.62 
 
 
462 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  24.18 
 
 
530 aa  101  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  24.47 
 
 
514 aa  100  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  26.06 
 
 
510 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  23.86 
 
 
505 aa  97.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  24.38 
 
 
536 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  25.99 
 
 
529 aa  95.5  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  23.79 
 
 
476 aa  91.3  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  23.78 
 
 
524 aa  90.9  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  25.49 
 
 
515 aa  90.1  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  29.03 
 
 
522 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  27.85 
 
 
520 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  31.76 
 
 
290 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  26.42 
 
 
523 aa  67  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  24.19 
 
 
492 aa  65.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  25.1 
 
 
485 aa  64.7  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  23.82 
 
 
533 aa  64.7  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  23.68 
 
 
534 aa  60.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  24.44 
 
 
526 aa  54.7  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  26.98 
 
 
277 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  26.67 
 
 
542 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  27.59 
 
 
312 aa  44.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  26.5 
 
 
516 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  27.19 
 
 
277 aa  43.5  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  26.73 
 
 
298 aa  43.5  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>