54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2585 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  100 
 
 
520 aa  1060    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  28.77 
 
 
526 aa  225  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  28.15 
 
 
516 aa  201  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  26.64 
 
 
533 aa  196  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  26.61 
 
 
534 aa  191  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  32.58 
 
 
277 aa  146  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  34.2 
 
 
309 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  34.63 
 
 
312 aa  134  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  33.21 
 
 
281 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  32.09 
 
 
281 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  31.5 
 
 
284 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  32.84 
 
 
281 aa  124  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  30.08 
 
 
290 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  31.08 
 
 
277 aa  113  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  24.01 
 
 
529 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  25.86 
 
 
505 aa  106  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  23.13 
 
 
528 aa  106  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  29.18 
 
 
285 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  22.68 
 
 
536 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  28.16 
 
 
497 aa  97.8  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  30.65 
 
 
295 aa  96.3  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  23.11 
 
 
530 aa  93.2  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  25.29 
 
 
515 aa  92.8  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  26.75 
 
 
514 aa  91.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  24.32 
 
 
315 aa  91.7  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  26.55 
 
 
524 aa  90.1  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  22.47 
 
 
510 aa  89.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  25.56 
 
 
523 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  25.1 
 
 
304 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  22.73 
 
 
476 aa  81.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  29.69 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  28.29 
 
 
298 aa  79.7  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  26.64 
 
 
522 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  31.32 
 
 
291 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  26.01 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  27.85 
 
 
516 aa  77.8  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  28.22 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  26.44 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  25.88 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  22.2 
 
 
542 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  21.67 
 
 
525 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  31.87 
 
 
213 aa  64.7  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  22.8 
 
 
492 aa  62.4  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  30.77 
 
 
358 aa  62  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  23.47 
 
 
462 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3885  hypothetical protein  23.87 
 
 
550 aa  57.4  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.315929  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  24.69 
 
 
508 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  29.38 
 
 
658 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2341  hypothetical protein  21.5 
 
 
217 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2198  EpsI family protein  22.64 
 
 
210 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0848  hypothetical protein  22.94 
 
 
206 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  22.83 
 
 
496 aa  47.4  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1978  hypothetical protein  24.03 
 
 
224 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2442  hypothetical protein  25.71 
 
 
210 aa  43.9  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>