54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0847 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  554  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  53.21 
 
 
309 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  53.44 
 
 
284 aa  258  6e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  55.6 
 
 
312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  49.64 
 
 
281 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  49.64 
 
 
281 aa  238  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  53.91 
 
 
277 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  34.68 
 
 
277 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  35.92 
 
 
285 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  33.58 
 
 
520 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  32.46 
 
 
526 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  33.2 
 
 
516 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  34.52 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  32.22 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  27.09 
 
 
534 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  31.85 
 
 
304 aa  106  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  30.5 
 
 
528 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  30.93 
 
 
533 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  30.56 
 
 
523 aa  99.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  33.47 
 
 
310 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  32.74 
 
 
298 aa  95.5  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  29.17 
 
 
529 aa  94.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  27.62 
 
 
536 aa  92.4  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  30.47 
 
 
514 aa  92.4  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  30.86 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  30 
 
 
510 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  29.49 
 
 
331 aa  86.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  28.63 
 
 
522 aa  85.5  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  28.16 
 
 
505 aa  85.5  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  37.5 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  25.54 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  27.5 
 
 
515 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  25.51 
 
 
524 aa  79  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  26.98 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  32.77 
 
 
213 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  27.31 
 
 
530 aa  70.1  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  31.22 
 
 
516 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  40.59 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  25.82 
 
 
476 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2911  hypothetical protein  29.06 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326024 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3885  hypothetical protein  28.46 
 
 
550 aa  62.4  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.315929  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  29 
 
 
525 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  25.33 
 
 
492 aa  60.1  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  25.53 
 
 
542 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  25.52 
 
 
485 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  23.35 
 
 
462 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2693  eight transmembrane protein EpsH  26.53 
 
 
297 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.609355  decreased coverage  0.00255345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  26.54 
 
 
658 aa  52.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  22.31 
 
 
497 aa  52.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0825  RND family efflux transporter subunit MFP  25.27 
 
 
309 aa  49.7  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.687604  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  20.89 
 
 
496 aa  48.9  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0448  hypothetical protein  23.75 
 
 
164 aa  43.5  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.608891  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1390  hypothetical protein  29.55 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.410056  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0005  eight transmembrane protein EpsH, putative  26.24 
 
 
245 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>