50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2342 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  100 
 
 		 277 aa  555  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  39.68 
 
 		 312 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  39.48 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  38.15 
 
 		 281 aa  175  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  36.33 
 
 		 526 aa  161  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  33.7 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  34.55 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  32.58 
 
 		 520 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  33.75 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  33.21 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  29.02 
 
 		 516 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  32.66 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  34.68 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  30.12 
 
 		 295 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  26.83 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  29.06 
 
 		 331 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  30.68 
 
 		 536 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  29.75 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  31.12 
 
 		 505 aa  99.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  29.32 
 
 		 533 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  27.14 
 
 		 514 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  30.08 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  28.02 
 
 		 315 aa  93.2  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  32.08 
 
 		 528 aa  92.8  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  27 
 
 		 497 aa  92  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  27.24 
 
 		 515 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  28.4 
 
 		 524 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  29.94 
 
 		 534 aa  84  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  25.69 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  25 
 
 		 510 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  27.35 
 
 		 476 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  27.2 
 
 		 523 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  26.34 
 
 		 530 aa  79  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  25.38 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  30.43 
 
 		 529 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  31.58 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  27.19 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  32.31 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  26.46 
 
 		 462 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  27.92 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  26.62 
 
 		 542 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  27.82 
 
 		 358 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  23.7 
 
 		 525 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2911  hypothetical protein  23.05 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  26.98 
 
 		 516 aa  49.7  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  28.67 
 
 		 658 aa  49.3  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  25 
 
 		 496 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  22.27 
 
 		 485 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5285  hypothetical protein  26.42 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3885  hypothetical protein  23.42 
 
 		 550 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.315929  normal  0.0708866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>