44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1792 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  584  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  54.31 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  48.97 
 
 		 304 aa  276  4e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  54.35 
 
 		 310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  50.76 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  43.59 
 
 		 331 aa  192  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  45.83 
 
 		 213 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  30.52 
 
 		 277 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  28.83 
 
 		 520 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  31.15 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  29.77 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  31.52 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  32.56 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  30.17 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  36.36 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  28.29 
 
 		 526 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  31.67 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  30.04 
 
 		 533 aa  93.6  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  31.23 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  29.17 
 
 		 510 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  31.28 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  30.4 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  26.05 
 
 		 534 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  28.16 
 
 		 514 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  28.88 
 
 		 529 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  28.93 
 
 		 505 aa  73.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  27.84 
 
 		 530 aa  69.7  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  26.44 
 
 		 524 aa  69.7  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  26.99 
 
 		 515 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  25.83 
 
 		 528 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  27.44 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  28.9 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  25.21 
 
 		 516 aa  63.2  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  22.63 
 
 		 536 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  25.2 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  25.33 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  25.76 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  35.21 
 
 		 658 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0825  RND family efflux transporter subunit MFP  26.85 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.687604  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  25.74 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  30.23 
 
 		 522 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  24.66 
 
 		 542 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  35.42 
 
 		 358 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5285  hypothetical protein  23.66 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>