43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0954 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  100 
 
 		 298 aa  593  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  30.52 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  34.3 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  32.97 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  30.05 
 
 		 534 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  25.94 
 
 		 520 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  31.05 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  33.73 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  29.82 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  25.7 
 
 		 526 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  28.79 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  31.93 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  30.87 
 
 		 533 aa  66.6  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  27.89 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  30.27 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  29.31 
 
 		 536 aa  62.4  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  27.2 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  32.09 
 
 		 542 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  23.32 
 
 		 516 aa  60.1  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  30.3 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  28.46 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2511  eight transmembrane protein EpsH  22.62 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  26.22 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3595  eight transmembrane protein EpsH  22.62 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  25.33 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  29.34 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  25.37 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  27.27 
 
 		 476 aa  53.5  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  29.3 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  23.51 
 
 		 528 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  25.45 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  25.1 
 
 		 505 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2911  hypothetical protein  26.19 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326024 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  26.09 
 
 		 522 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  32.11 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  28.03 
 
 		 529 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  27.88 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  27.95 
 
 		 510 aa  47  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  26.53 
 
 		 515 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  26.49 
 
 		 497 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  27.63 
 
 		 530 aa  43.9  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2692  hypothetical protein  30.43 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.863316  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  26.73 
 
 		 516 aa  42.4  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>