43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2328 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  1028    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  43.1 
 
 		 492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  33.33 
 
 		 529 aa  183  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  32.14 
 
 		 510 aa  177  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  39.21 
 
 		 523 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  29.79 
 
 		 524 aa  171  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  29.15 
 
 		 514 aa  166  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  31.76 
 
 		 530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  39.5 
 
 		 505 aa  159  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  36.76 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  30.99 
 
 		 476 aa  148  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  25.83 
 
 		 497 aa  147  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  38.36 
 
 		 515 aa  144  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  27.99 
 
 		 536 aa  141  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  34.57 
 
 		 485 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  24.15 
 
 		 526 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  23.84 
 
 		 516 aa  101  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  31.65 
 
 		 281 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  24.17 
 
 		 496 aa  92  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  30.51 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  28.8 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  30.52 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  25.63 
 
 		 533 aa  80.1  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  25.18 
 
 		 277 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  26.6 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  28.05 
 
 		 516 aa  78.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  25.09 
 
 		 462 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  26.3 
 
 		 534 aa  73.6  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  25.38 
 
 		 290 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  26.98 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  28.22 
 
 		 281 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  24.33 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  28.17 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  25.75 
 
 		 315 aa  67  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  26.82 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  25.76 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  25.45 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  31.91 
 
 		 331 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  25.37 
 
 		 525 aa  54.3  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  23.93 
 
 		 295 aa  50.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  30.87 
 
 		 658 aa  50.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  24.45 
 
 		 542 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  26.19 
 
 		 310 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>