43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1173 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  100 
 
 		 497 aa  1014    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  40.66 
 
 		 476 aa  324  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  30.25 
 
 		 510 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  30.34 
 
 		 514 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  29.4 
 
 		 529 aa  204  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  27.66 
 
 		 524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  29.44 
 
 		 530 aa  197  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  29.82 
 
 		 536 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  28.28 
 
 		 505 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  28.23 
 
 		 528 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  35.59 
 
 		 515 aa  182  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  27.58 
 
 		 523 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  28.42 
 
 		 492 aa  149  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  31.99 
 
 		 522 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  25.76 
 
 		 496 aa  137  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  29.96 
 
 		 485 aa  126  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  24.66 
 
 		 516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  25 
 
 		 508 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  28.16 
 
 		 520 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  29.29 
 
 		 290 aa  93.6  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  27 
 
 		 277 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  21.98 
 
 		 526 aa  89.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  23.08 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  23.2 
 
 		 525 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  24.14 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  25.72 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  30.69 
 
 		 304 aa  66.6  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  21.87 
 
 		 533 aa  64.3  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  25.78 
 
 		 312 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  25.1 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  26.25 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  26.17 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  27.04 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  26.94 
 
 		 281 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  24.87 
 
 		 284 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  26.28 
 
 		 285 aa  54.7  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  20.58 
 
 		 534 aa  51.6  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  27 
 
 		 310 aa  50.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  31.11 
 
 		 298 aa  48.9  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  21.79 
 
 		 277 aa  48.5  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  28.85 
 
 		 658 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  25.93 
 
 		 298 aa  43.5  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5285  hypothetical protein  27.33 
 
 		 293 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>