54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2443 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  100 
 
 		 312 aa  613  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  66.42 
 
 		 281 aa  328  7e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  65.36 
 
 		 281 aa  321  9.000000000000001e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  58.61 
 
 		 277 aa  273  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  54.51 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  48.94 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  49.08 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  38.06 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  38 
 
 		 526 aa  166  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  34.96 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  34.04 
 
 		 520 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  33.1 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  34.52 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  31.06 
 
 		 516 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  34.69 
 
 		 533 aa  109  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  30.59 
 
 		 514 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  29.03 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  28.14 
 
 		 534 aa  95.9  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  27.92 
 
 		 529 aa  95.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  31.76 
 
 		 522 aa  92.4  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  27.65 
 
 		 524 aa  92.4  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  26.1 
 
 		 536 aa  88.6  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  26.83 
 
 		 505 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  30.36 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  27.41 
 
 		 315 aa  86.3  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  29.67 
 
 		 515 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  30.8 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  29.76 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  28.91 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  27.73 
 
 		 510 aa  82  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  34.64 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  24.4 
 
 		 523 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  25.72 
 
 		 497 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  28.22 
 
 		 528 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  26.47 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  31.96 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  31.45 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  28.85 
 
 		 530 aa  67  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  24.51 
 
 		 542 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  25.11 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3885  hypothetical protein  27.7 
 
 		 550 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.315929  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  26.47 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  24.31 
 
 		 496 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  31.65 
 
 		 658 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2911  hypothetical protein  25.32 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  29.01 
 
 		 516 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  32.47 
 
 		 358 aa  52.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0825  RND family efflux transporter subunit MFP  24.81 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.687604  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  27.44 
 
 		 525 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  27.91 
 
 		 508 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  22.78 
 
 		 462 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2693  eight transmembrane protein EpsH  24.71 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.609355  decreased coverage  0.00255345 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1390  hypothetical protein  25.16 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.410056  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4958  hypothetical protein  29.59 
 
 		 453 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0562116  normal  0.187789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>