52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1978 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1031    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  42.2 
 
 		 529 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  37.47 
 
 		 524 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  36.84 
 
 		 530 aa  297  3e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  41.6 
 
 		 515 aa  297  4e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  37.05 
 
 		 514 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  35.89 
 
 		 536 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  35.23 
 
 		 528 aa  257  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  32.72 
 
 		 505 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  31.15 
 
 		 476 aa  247  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  30.25 
 
 		 497 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  29.9 
 
 		 523 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  37.19 
 
 		 485 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  32.17 
 
 		 492 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  32.2 
 
 		 522 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  26.85 
 
 		 496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  26.37 
 
 		 525 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  23.96 
 
 		 526 aa  124  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  24.69 
 
 		 508 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  26.06 
 
 		 516 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  29.79 
 
 		 462 aa  96.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  29.57 
 
 		 290 aa  95.1  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  22.79 
 
 		 533 aa  90.1  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  31.13 
 
 		 284 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  22.47 
 
 		 520 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  28.62 
 
 		 331 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  30.28 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  22.67 
 
 		 516 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  27.24 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  31.11 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  25 
 
 		 277 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  24.65 
 
 		 534 aa  81.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  31.66 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  29.35 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  24.01 
 
 		 315 aa  69.3  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  27.43 
 
 		 277 aa  69.3  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  29.22 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  27.2 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0825  RND family efflux transporter subunit MFP  29.9 
 
 		 309 aa  63.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.687604  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  24.3 
 
 		 304 aa  63.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  27.73 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2911  hypothetical protein  28.78 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2693  eight transmembrane protein EpsH  26.64 
 
 		 297 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.609355  decreased coverage  0.00255345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  29.24 
 
 		 213 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  27.94 
 
 		 310 aa  53.9  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  26.25 
 
 		 542 aa  50.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2511  eight transmembrane protein EpsH  25.74 
 
 		 302 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3595  eight transmembrane protein EpsH  25.25 
 
 		 302 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  25.58 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  29.6 
 
 		 298 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  25.26 
 
 		 358 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  29.44 
 
 		 658 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>