47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0720 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  624  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  50.72 
 
 		 304 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  52.03 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  49.43 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  51.61 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  39.22 
 
 		 331 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  46.57 
 
 		 213 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  30.77 
 
 		 533 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  29.75 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  36.69 
 
 		 309 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  28.79 
 
 		 281 aa  96.3  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  37.87 
 
 		 284 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  29.41 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  29.27 
 
 		 526 aa  86.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  28.68 
 
 		 285 aa  85.9  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  29.07 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  28.25 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  30.74 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  26.05 
 
 		 534 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  26.44 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  34.06 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  34.72 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  27.46 
 
 		 522 aa  69.7  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  25.46 
 
 		 505 aa  66.2  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  25.68 
 
 		 524 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  28.51 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  28.57 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  26.91 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  26.69 
 
 		 530 aa  56.6  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  26.03 
 
 		 528 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  27.63 
 
 		 514 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  28.57 
 
 		 523 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  24.17 
 
 		 536 aa  52.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  22.44 
 
 		 492 aa  50.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  24.42 
 
 		 476 aa  49.7  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  24.43 
 
 		 497 aa  49.3  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  31.88 
 
 		 358 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  23.64 
 
 		 510 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  25.27 
 
 		 485 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  30.86 
 
 		 658 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  27.66 
 
 		 508 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  26.39 
 
 		 516 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  24.37 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5285  hypothetical protein  24.74 
 
 		 293 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  25.79 
 
 		 529 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  26.61 
 
 		 525 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0825  RND family efflux transporter subunit MFP  26.29 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.687604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>