58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2581 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  100 
 
 
516 aa  1034    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  42.02 
 
 
526 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  32.38 
 
 
533 aa  249  8e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  30.96 
 
 
534 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  28.63 
 
 
520 aa  209  9e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  29.02 
 
 
277 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  33.07 
 
 
281 aa  131  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  33.33 
 
 
281 aa  127  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  33.33 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  33.08 
 
 
284 aa  115  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  33.9 
 
 
290 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  33.6 
 
 
277 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  25.4 
 
 
522 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  31.45 
 
 
312 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  33.2 
 
 
281 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  30.74 
 
 
285 aa  99.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  27.66 
 
 
315 aa  94  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  25.57 
 
 
530 aa  93.6  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  23.58 
 
 
528 aa  92.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  23.29 
 
 
529 aa  89  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  24.02 
 
 
505 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  22.94 
 
 
510 aa  89  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  22.27 
 
 
476 aa  87.8  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  30.8 
 
 
515 aa  87  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  22.29 
 
 
497 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0671  EpsI family protein  31.84 
 
 
243 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  29.09 
 
 
331 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  24.04 
 
 
514 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  25.05 
 
 
536 aa  80.9  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  23.28 
 
 
524 aa  80.1  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1978  hypothetical protein  29.36 
 
 
224 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  24.84 
 
 
523 aa  75.1  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2198  EpsI family protein  27.8 
 
 
210 aa  73.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3885  hypothetical protein  27.89 
 
 
550 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.315929  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0848  hypothetical protein  30.1 
 
 
206 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  25.29 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  26.09 
 
 
492 aa  67.4  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  31.15 
 
 
542 aa  65.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2341  hypothetical protein  24.38 
 
 
217 aa  63.9  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  24.57 
 
 
525 aa  63.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  27.95 
 
 
304 aa  63.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3053  hypothetical protein  27 
 
 
206 aa  63.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  23.99 
 
 
658 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2442  hypothetical protein  27.03 
 
 
210 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  25.33 
 
 
485 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  25.38 
 
 
310 aa  58.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  30.26 
 
 
213 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  23.65 
 
 
298 aa  58.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1804  EpsI family protein  24.76 
 
 
208 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  28.37 
 
 
358 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  28.57 
 
 
318 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2446  EpsI family protein  24.47 
 
 
208 aa  54.7  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  25.43 
 
 
298 aa  54.7  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  32.12 
 
 
291 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  22.9 
 
 
508 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0721  hypothetical protein  25.59 
 
 
250 aa  44.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.34975  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1390  hypothetical protein  26.73 
 
 
270 aa  44.7  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.410056  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  26.5 
 
 
516 aa  44.3  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>