16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0848 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0848  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  425  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1804  EpsI family protein  45.89 
 
 
208 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2198  EpsI family protein  40.58 
 
 
210 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2446  EpsI family protein  48.39 
 
 
208 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0671  EpsI family protein  49.17 
 
 
243 aa  167  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2442  hypothetical protein  45.15 
 
 
210 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3053  hypothetical protein  43.08 
 
 
206 aa  144  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  33.01 
 
 
526 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  31.55 
 
 
533 aa  99.4  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1978  hypothetical protein  29.03 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2341  hypothetical protein  26.7 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  30.81 
 
 
516 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2002  hypothetical protein  27.78 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  24.55 
 
 
534 aa  58.9  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  22.94 
 
 
520 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1791  hypothetical protein  24.4 
 
 
230 aa  42  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>