20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2442 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2442  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1804  EpsI family protein  58.62 
 
 
208 aa  232  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2198  EpsI family protein  48.33 
 
 
210 aa  217  8.999999999999998e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2446  EpsI family protein  58.6 
 
 
208 aa  209  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0848  hypothetical protein  45.37 
 
 
206 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0671  EpsI family protein  40.34 
 
 
243 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3053  hypothetical protein  40.57 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  31.84 
 
 
526 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1978  hypothetical protein  29.58 
 
 
224 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2341  hypothetical protein  28.7 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  29.9 
 
 
533 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  25.93 
 
 
534 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  27.03 
 
 
516 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1791  hypothetical protein  26.09 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  23.26 
 
 
520 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0247  hypothetical protein  28.87 
 
 
227 aa  52.8  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2351  EpsI family protein  26.06 
 
 
238 aa  48.9  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2002  hypothetical protein  27.49 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2368  methanolan biosynthesis EpsI  23.61 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1392  hypothetical protein  33.33 
 
 
196 aa  42.4  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.276948  normal  0.344079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>