12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2351 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2351  EpsI family protein  100 
 
 		 238 aa  493  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0247  hypothetical protein  48 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1791  hypothetical protein  43.78 
 
 		 230 aa  194  7e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2022  hypothetical protein  37.79 
 
 		 226 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.672129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1018  hypothetical protein  34.45 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2368  methanolan biosynthesis EpsI  26.76 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0721  hypothetical protein  28.72 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.34975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2198  EpsI family protein  23.33 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0580  hypothetical protein  26.09 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.440699  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2442  hypothetical protein  26.06 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2446  EpsI family protein  23.78 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1804  EpsI family protein  22.82 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>