15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0721 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0721  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  496  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.34975  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0247  hypothetical protein  34.54 
 
 
227 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1791  hypothetical protein  33.83 
 
 
230 aa  102  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2022  hypothetical protein  30.67 
 
 
226 aa  102  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.672129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1018  hypothetical protein  32.43 
 
 
215 aa  95.5  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2351  EpsI family protein  28.64 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2368  methanolan biosynthesis EpsI  32.31 
 
 
248 aa  85.5  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  27.32 
 
 
533 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  25.73 
 
 
534 aa  49.7  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2002  hypothetical protein  27.56 
 
 
207 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2446  EpsI family protein  26.39 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1804  EpsI family protein  23.89 
 
 
208 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  25.59 
 
 
516 aa  45.8  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1978  hypothetical protein  22.82 
 
 
224 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0580  hypothetical protein  23.03 
 
 
230 aa  42.4  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.440699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>