20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2446 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2446  EpsI family protein  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1804  EpsI family protein  94.23 
 
 		 208 aa  383  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2442  hypothetical protein  59.02 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0848  hypothetical protein  47.34 
 
 		 206 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2198  EpsI family protein  43.27 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0671  EpsI family protein  40.88 
 
 		 243 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  32.2 
 
 		 526 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3053  hypothetical protein  35 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  29.38 
 
 		 533 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2341  hypothetical protein  27.36 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1978  hypothetical protein  27.96 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  24.21 
 
 		 534 aa  61.6  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  24.6 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2002  hypothetical protein  25.27 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1791  hypothetical protein  26.57 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2351  EpsI family protein  22.4 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  26.95 
 
 		 529 aa  48.9  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  23.49 
 
 		 520 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0721  hypothetical protein  26.14 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.34975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  23.97 
 
 		 510 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>