50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2521 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  100 
 
 
529 aa  1068    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  45.16 
 
 
515 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  40.39 
 
 
514 aa  372  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  41.62 
 
 
528 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  41.07 
 
 
530 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  42.2 
 
 
510 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  40.33 
 
 
536 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  41.53 
 
 
524 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  38.82 
 
 
505 aa  334  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  30.78 
 
 
523 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  29.41 
 
 
476 aa  207  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  29.4 
 
 
497 aa  204  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  33.42 
 
 
522 aa  177  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  29.04 
 
 
492 aa  169  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  34.83 
 
 
485 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  24.59 
 
 
496 aa  130  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  25.96 
 
 
525 aa  127  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  24.06 
 
 
526 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  25.15 
 
 
508 aa  114  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  24.01 
 
 
520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  30.8 
 
 
290 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  25.99 
 
 
516 aa  95.5  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  31.33 
 
 
462 aa  93.2  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  32.49 
 
 
277 aa  90.5  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  29.02 
 
 
285 aa  90.1  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  28.89 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  23.17 
 
 
516 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  28.97 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  24.51 
 
 
533 aa  81.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  30.58 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  27.07 
 
 
312 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  29.68 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  30.43 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  27.69 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  25.21 
 
 
315 aa  65.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  21.01 
 
 
534 aa  63.9  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  30.6 
 
 
298 aa  62.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  28.94 
 
 
295 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  25.53 
 
 
331 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  26.87 
 
 
310 aa  53.9  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  33.9 
 
 
658 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0825  RND family efflux transporter subunit MFP  25.52 
 
 
309 aa  51.2  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.687604  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2692  hypothetical protein  34.07 
 
 
306 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.863316  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  26.79 
 
 
358 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3424  hypothetical protein  32.97 
 
 
306 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  27.74 
 
 
304 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5285  hypothetical protein  26.09 
 
 
293 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  29.41 
 
 
542 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  27.42 
 
 
298 aa  47  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2911  hypothetical protein  26.03 
 
 
306 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>