48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0140 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  100 
 
 
524 aa  1039    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  60.2 
 
 
514 aa  569  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  60.36 
 
 
530 aa  555  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  41.73 
 
 
529 aa  351  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  41.77 
 
 
536 aa  340  5e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  40.53 
 
 
505 aa  326  6e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  38.06 
 
 
510 aa  319  7.999999999999999e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  41.54 
 
 
528 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  40.04 
 
 
515 aa  312  7.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  28.1 
 
 
476 aa  222  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  27.23 
 
 
497 aa  206  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  29.18 
 
 
523 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  33.69 
 
 
485 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  31.45 
 
 
492 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  29.48 
 
 
522 aa  161  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  28.41 
 
 
525 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  22.57 
 
 
508 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  25.52 
 
 
526 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  21.62 
 
 
496 aa  106  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  30.12 
 
 
290 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  23.42 
 
 
516 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  27.32 
 
 
520 aa  99.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  29.45 
 
 
462 aa  93.6  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  28.4 
 
 
277 aa  91.3  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  22.47 
 
 
534 aa  86.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  24.1 
 
 
516 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  30.49 
 
 
281 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  28.25 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  30.8 
 
 
309 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  28.05 
 
 
533 aa  81.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  29.91 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  28.79 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  26.34 
 
 
295 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  24.19 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  25.09 
 
 
315 aa  70.1  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  27.39 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  22.94 
 
 
277 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  26.09 
 
 
281 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  36.44 
 
 
658 aa  57.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  25.68 
 
 
318 aa  57.4  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  25.54 
 
 
298 aa  53.5  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3424  hypothetical protein  36.59 
 
 
306 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2692  hypothetical protein  36.59 
 
 
306 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.863316  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  24.28 
 
 
304 aa  50.4  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5285  hypothetical protein  29.03 
 
 
293 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  27.54 
 
 
213 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  23.66 
 
 
310 aa  47.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3934  hypothetical protein  29.63 
 
 
279 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00016273  normal  0.168995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>