44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0246 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  69.42 
 
 
310 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  54.42 
 
 
295 aa  326  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  50.72 
 
 
318 aa  268  7e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  50.38 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  39.69 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  42.05 
 
 
213 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  33.22 
 
 
309 aa  119  9e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  31.6 
 
 
284 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  26.83 
 
 
277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  30.86 
 
 
281 aa  95.9  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  31.2 
 
 
277 aa  89.7  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  33.52 
 
 
281 aa  89  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  26.25 
 
 
533 aa  88.2  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  25.45 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  25.1 
 
 
520 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  24.2 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  29.84 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  27.45 
 
 
526 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  28.79 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  30.36 
 
 
534 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  27.44 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  25.77 
 
 
514 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  30.69 
 
 
497 aa  66.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  27.95 
 
 
516 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2511  eight transmembrane protein EpsH  26.09 
 
 
302 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  27.35 
 
 
476 aa  63.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  24.3 
 
 
510 aa  63.2  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3595  eight transmembrane protein EpsH  25.75 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0825  RND family efflux transporter subunit MFP  30.32 
 
 
309 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.687604  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  28.35 
 
 
530 aa  57.4  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  24.11 
 
 
522 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  28.15 
 
 
523 aa  57  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2911  hypothetical protein  27.5 
 
 
306 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  25.45 
 
 
298 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  24.28 
 
 
524 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5285  hypothetical protein  25.6 
 
 
293 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  27.74 
 
 
529 aa  49.3  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  27.38 
 
 
542 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2693  eight transmembrane protein EpsH  29.07 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.609355  decreased coverage  0.00255345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  28.66 
 
 
658 aa  46.2  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  23.28 
 
 
515 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  26.92 
 
 
505 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  24.22 
 
 
536 aa  42.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>