50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2406 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  1008    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  47.78 
 
 		 528 aa  450  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  40.29 
 
 		 536 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  38.83 
 
 		 529 aa  345  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  40.92 
 
 		 514 aa  335  9e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  40.21 
 
 		 524 aa  329  7e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  40.76 
 
 		 515 aa  325  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  38.01 
 
 		 530 aa  318  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  32.87 
 
 		 510 aa  260  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  29.55 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  27.53 
 
 		 497 aa  186  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  29.08 
 
 		 523 aa  179  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  38.06 
 
 		 522 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  26.56 
 
 		 492 aa  156  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  33.22 
 
 		 485 aa  153  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  25.47 
 
 		 508 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  23.16 
 
 		 496 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  30.61 
 
 		 290 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  24.46 
 
 		 525 aa  110  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  24.5 
 
 		 526 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  25.86 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  25.62 
 
 		 516 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  32.67 
 
 		 277 aa  99.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  31.12 
 
 		 277 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  30.99 
 
 		 284 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  29.73 
 
 		 309 aa  94  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  24.01 
 
 		 516 aa  86.7  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  30.8 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  26.09 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  29.17 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  29.64 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  27.02 
 
 		 312 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  22.02 
 
 		 533 aa  70.5  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  23.18 
 
 		 331 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  26.55 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  23.48 
 
 		 315 aa  62.8  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  30.41 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  26.07 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  29.2 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  21.77 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  28.77 
 
 		 658 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  26.32 
 
 		 358 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  27.86 
 
 		 310 aa  51.2  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  24.69 
 
 		 295 aa  50.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  24.09 
 
 		 298 aa  47.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1978  hypothetical protein  25.42 
 
 		 224 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3424  hypothetical protein  33.7 
 
 		 306 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  26.69 
 
 		 304 aa  45.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  27.78 
 
 		 213 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2692  hypothetical protein  32.61 
 
 		 306 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.863316  normal  0.879748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>