42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1470 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  100 
 
 
315 aa  637    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  29.06 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  26.43 
 
 
526 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  27.66 
 
 
516 aa  94  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  28.02 
 
 
277 aa  93.2  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  24.32 
 
 
520 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  28.28 
 
 
285 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  26.84 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  26.78 
 
 
514 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  28.57 
 
 
515 aa  79.3  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  25.38 
 
 
530 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  26.84 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  24.79 
 
 
536 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  25.09 
 
 
524 aa  70.1  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  27.94 
 
 
523 aa  69.7  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  24.01 
 
 
510 aa  69.3  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  25.96 
 
 
528 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  25.64 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  28.83 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  25.75 
 
 
522 aa  66.6  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  27.08 
 
 
534 aa  65.9  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  25.21 
 
 
529 aa  65.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  26.77 
 
 
485 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  34.53 
 
 
533 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  24.11 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  27.11 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  23.48 
 
 
505 aa  62.8  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  25.1 
 
 
497 aa  62.4  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  31.25 
 
 
658 aa  59.7  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  24.15 
 
 
476 aa  59.7  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  26.4 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  24.68 
 
 
281 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  22.63 
 
 
542 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  32.29 
 
 
291 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  28.1 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  29.41 
 
 
508 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2911  hypothetical protein  25.9 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326024 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  30.09 
 
 
525 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  21.85 
 
 
496 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  26.03 
 
 
298 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3595  eight transmembrane protein EpsH  25.21 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2511  eight transmembrane protein EpsH  25.21 
 
 
302 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>