49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0290 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1023    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  45.75 
 
 		 529 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  42.3 
 
 		 528 aa  355  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  42.68 
 
 		 536 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  40.92 
 
 		 505 aa  336  7.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  41.8 
 
 		 510 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  40.31 
 
 		 514 aa  322  8e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  41.49 
 
 		 530 aa  322  8e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  40.73 
 
 		 524 aa  315  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  29.4 
 
 		 476 aa  207  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  33.91 
 
 		 523 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  27.57 
 
 		 497 aa  187  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  32.58 
 
 		 492 aa  167  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  38.36 
 
 		 522 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  33.22 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  31.49 
 
 		 290 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  26.07 
 
 		 508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  22.32 
 
 		 496 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  25.91 
 
 		 526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  29.77 
 
 		 525 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  24.81 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  25.24 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  27.34 
 
 		 277 aa  98.2  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  30.46 
 
 		 462 aa  92.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  30.8 
 
 		 516 aa  91.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  24.65 
 
 		 533 aa  88.6  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  28.57 
 
 		 315 aa  82.8  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  28.52 
 
 		 331 aa  80.1  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  26.56 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  27.31 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  26.41 
 
 		 285 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  29.48 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  27.95 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  27.89 
 
 		 312 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  28.57 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  27.27 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  23.46 
 
 		 534 aa  66.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  27.57 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  23.53 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  27.65 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  33.33 
 
 		 658 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0825  RND family efflux transporter subunit MFP  27.01 
 
 		 309 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.687604  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5285  hypothetical protein  27.87 
 
 		 293 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2911  hypothetical protein  25.32 
 
 		 306 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  23.37 
 
 		 304 aa  50.4  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  21.94 
 
 		 542 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  27.06 
 
 		 310 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  26.78 
 
 		 213 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2693  eight transmembrane protein EpsH  25.22 
 
 		 297 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.609355  decreased coverage  0.00255345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>