34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0140 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  1026    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  28.43 
 
 		 516 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  23.09 
 
 		 514 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  26.35 
 
 		 496 aa  131  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  24.24 
 
 		 510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  23.17 
 
 		 524 aa  127  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  25.64 
 
 		 505 aa  126  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  26.07 
 
 		 515 aa  123  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  25.15 
 
 		 529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  21.69 
 
 		 536 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  24.78 
 
 		 525 aa  115  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  28.36 
 
 		 528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  25.42 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  25.59 
 
 		 497 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  23.6 
 
 		 530 aa  103  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  20.51 
 
 		 476 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  28.95 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  26 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  23.81 
 
 		 522 aa  73.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  22.54 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  27.8 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  24.69 
 
 		 520 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  22.38 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  27.12 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  23.41 
 
 		 309 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  26.54 
 
 		 315 aa  53.9  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5285  hypothetical protein  24.84 
 
 		 293 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  25.49 
 
 		 310 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  26.55 
 
 		 295 aa  48.5  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  27.63 
 
 		 312 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  22.89 
 
 		 285 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  24.02 
 
 		 284 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  24.53 
 
 		 281 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0717  hypothetical protein  27.59 
 
 		 277 aa  43.5  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.952831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>