52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2003 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  36.82 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  33.75 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  36.26 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  35.27 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  32.47 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  37.24 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  35.47 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  32.14 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  35.92 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  30.9 
 
 		 526 aa  118  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  29.18 
 
 		 520 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  30.08 
 
 		 516 aa  99  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  29.09 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  32.72 
 
 		 536 aa  95.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  29.02 
 
 		 529 aa  90.1  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  32.34 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  28.28 
 
 		 315 aa  87  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  29.49 
 
 		 514 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  27.59 
 
 		 331 aa  85.5  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  28.12 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  28.85 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  29.05 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  29.11 
 
 		 505 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  28.82 
 
 		 522 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  24.2 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  28.83 
 
 		 528 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  24.33 
 
 		 534 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  29.35 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  29.74 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2911  hypothetical protein  27.06 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  34.59 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0825  RND family efflux transporter subunit MFP  27.06 
 
 		 309 aa  72  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.687604  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  25.11 
 
 		 515 aa  71.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  30.83 
 
 		 530 aa  70.5  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  25.88 
 
 		 525 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  29.28 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  23.83 
 
 		 476 aa  62.8  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  24.84 
 
 		 658 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2693  eight transmembrane protein EpsH  23.88 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.609355  decreased coverage  0.00255345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  25 
 
 		 462 aa  59.3  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  24.18 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  28.47 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  26.28 
 
 		 497 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  23.79 
 
 		 485 aa  52.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  26.99 
 
 		 496 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  22.88 
 
 		 542 aa  50.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  29.09 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5285  hypothetical protein  23.32 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2692  hypothetical protein  25.4 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.863316  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3424  hypothetical protein  25.7 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  22.22 
 
 		 516 aa  42.7  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>