36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2528 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  699    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3885  hypothetical protein  42.75 
 
 		 550 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.315929  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  30.23 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  31.72 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  31.91 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  31.68 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  40.2 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  31.43 
 
 		 542 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  35.94 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  28.03 
 
 		 516 aa  56.6  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  25.37 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  23.77 
 
 		 505 aa  56.2  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  33.03 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  35.43 
 
 		 281 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  26.11 
 
 		 310 aa  54.7  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  27.34 
 
 		 277 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  26.83 
 
 		 536 aa  53.1  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  28.57 
 
 		 528 aa  52.8  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  31.41 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  25.52 
 
 		 529 aa  51.2  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  33.04 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  29.09 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  28.85 
 
 		 533 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  25.61 
 
 		 514 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  22.7 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  24.22 
 
 		 515 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  23.6 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  24.83 
 
 		 497 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  26.42 
 
 		 510 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  27.56 
 
 		 331 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  30.41 
 
 		 318 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  27.94 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  26.47 
 
 		 530 aa  43.9  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  29.93 
 
 		 213 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  28.86 
 
 		 492 aa  42.7  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  26.83 
 
 		 523 aa  42.7  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>