55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2447 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  100 
 
 		 281 aa  553  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  95.73 
 
 		 281 aa  500  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  66.92 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  58.17 
 
 		 277 aa  268  8e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  50.54 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  48.39 
 
 		 309 aa  231  9e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  49.64 
 
 		 281 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  38.75 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  37.77 
 
 		 526 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  37.24 
 
 		 285 aa  155  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  32.84 
 
 		 520 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  33.33 
 
 		 516 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  34.39 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  30.94 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  33.2 
 
 		 533 aa  108  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  31.28 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  32.49 
 
 		 522 aa  105  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  28.33 
 
 		 534 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  31.13 
 
 		 510 aa  96.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  31.6 
 
 		 505 aa  96.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  31.22 
 
 		 523 aa  96.3  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  31.93 
 
 		 331 aa  96.3  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  30.86 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  29.12 
 
 		 524 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  29.18 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  30.99 
 
 		 514 aa  92.4  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  26.84 
 
 		 315 aa  91.3  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  30.24 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  33.62 
 
 		 492 aa  89.4  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  29.22 
 
 		 529 aa  89  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  26.64 
 
 		 515 aa  79.7  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  27.5 
 
 		 528 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  27.05 
 
 		 536 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  26.17 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  29.8 
 
 		 530 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  26.35 
 
 		 497 aa  72.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  32.26 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  28.63 
 
 		 485 aa  66.2  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  26.77 
 
 		 542 aa  65.9  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  29.36 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  27.15 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  34.93 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3885  hypothetical protein  30.04 
 
 		 550 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.315929  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  31.87 
 
 		 658 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2693  eight transmembrane protein EpsH  24.9 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.609355  decreased coverage  0.00255345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  27.04 
 
 		 525 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  26.69 
 
 		 516 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4958  hypothetical protein  28.98 
 
 		 453 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0562116  normal  0.187789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2911  hypothetical protein  25.38 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0825  RND family efflux transporter subunit MFP  27 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.687604  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  19.84 
 
 		 462 aa  46.6  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  24.53 
 
 		 508 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1390  hypothetical protein  24.84 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.410056  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0005  eight transmembrane protein EpsH, putative  27.81 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>