34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3885 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3885  hypothetical protein  100 
 
 		 550 aa  1083    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.315929  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3450  hypothetical protein  34.27 
 
 		 253 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.208016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  27.09 
 
 		 516 aa  94  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  41.79 
 
 		 358 aa  91.7  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  25.44 
 
 		 526 aa  89.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  24.21 
 
 		 520 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  26.96 
 
 		 533 aa  82.4  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  32.28 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  29.52 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  29.6 
 
 		 312 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  25.68 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  29.18 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  30.17 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  31.52 
 
 		 290 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  34.06 
 
 		 281 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  29.74 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  25.35 
 
 		 277 aa  62.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  27.82 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  25.96 
 
 		 277 aa  54.7  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  31.62 
 
 		 331 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  28.37 
 
 		 514 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  30.36 
 
 		 485 aa  53.5  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  30.77 
 
 		 524 aa  53.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  23.48 
 
 		 529 aa  51.6  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  28.26 
 
 		 295 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  27.68 
 
 		 505 aa  47.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  30.08 
 
 		 530 aa  47.4  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  31.07 
 
 		 291 aa  47  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  30.77 
 
 		 658 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2198  EpsI family protein  22.83 
 
 		 210 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  24.92 
 
 		 515 aa  45.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  26.96 
 
 		 310 aa  44.3  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  32.32 
 
 		 298 aa  43.9  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  27.27 
 
 		 213 aa  43.9  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>