54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4271 on replicon NC_007801
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  100 
 
 
534 aa  1081    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  45.98 
 
 
533 aa  465  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  31.25 
 
 
526 aa  242  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  30.75 
 
 
516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  26.61 
 
 
520 aa  195  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  29.91 
 
 
284 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  27.56 
 
 
281 aa  94  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  27.92 
 
 
281 aa  92.8  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  27.92 
 
 
331 aa  93.2  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  26.62 
 
 
290 aa  90.5  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  24.28 
 
 
510 aa  90.1  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  28.4 
 
 
309 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  28.33 
 
 
281 aa  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  23.44 
 
 
530 aa  85.9  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  26.5 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  25.68 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  23.76 
 
 
524 aa  84.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  30.42 
 
 
312 aa  84  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  24.83 
 
 
304 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  26.05 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  25.31 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  25.48 
 
 
523 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1978  hypothetical protein  27.93 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  24.69 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  24.33 
 
 
285 aa  77  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  22.5 
 
 
514 aa  75.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  25.21 
 
 
522 aa  74.7  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2198  EpsI family protein  27.32 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  31.68 
 
 
298 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  25.48 
 
 
515 aa  72  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  26.79 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  25.71 
 
 
528 aa  71.2  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  22.13 
 
 
536 aa  69.3  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  27.08 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  23.68 
 
 
516 aa  67.8  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  21.77 
 
 
505 aa  67  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  21.24 
 
 
529 aa  65.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  21.66 
 
 
476 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  22.27 
 
 
525 aa  63.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0848  hypothetical protein  24.55 
 
 
206 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0671  EpsI family protein  27.45 
 
 
243 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2442  hypothetical protein  25 
 
 
210 aa  57  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3053  hypothetical protein  29.45 
 
 
206 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1804  EpsI family protein  24.74 
 
 
208 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  21.64 
 
 
542 aa  54.3  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  20.58 
 
 
497 aa  53.9  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2446  EpsI family protein  24.21 
 
 
208 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  23.72 
 
 
496 aa  50.4  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  21.74 
 
 
492 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3885  hypothetical protein  25.87 
 
 
550 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.315929  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  26.79 
 
 
213 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  23.58 
 
 
485 aa  46.6  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0721  hypothetical protein  24.75 
 
 
250 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.34975  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1791  hypothetical protein  24.59 
 
 
230 aa  44.3  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>