17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1791 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1791  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  472  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0247  hypothetical protein  51.24 
 
 
227 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2351  EpsI family protein  45.27 
 
 
238 aa  195  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2022  hypothetical protein  40.89 
 
 
226 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.672129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1018  hypothetical protein  38.89 
 
 
215 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0721  hypothetical protein  34.52 
 
 
250 aa  102  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.34975  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2368  methanolan biosynthesis EpsI  29.32 
 
 
248 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0580  hypothetical protein  27.72 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.440699  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2198  EpsI family protein  23.44 
 
 
210 aa  58.9  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1978  hypothetical protein  22.68 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2446  EpsI family protein  26.57 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2442  hypothetical protein  26.09 
 
 
210 aa  48.5  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1804  EpsI family protein  25.87 
 
 
208 aa  48.9  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  24.59 
 
 
534 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0848  hypothetical protein  24.31 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  41.67 
 
 
533 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2002  hypothetical protein  26.44 
 
 
207 aa  41.6  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>