12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2002 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2002  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0848  hypothetical protein  27.57 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1804  EpsI family protein  23.92 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  22.38 
 
 		 526 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2446  EpsI family protein  23.66 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2198  EpsI family protein  24.27 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2022  hypothetical protein  36.36 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.672129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0721  hypothetical protein  27.56 
 
 		 250 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.34975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  24.36 
 
 		 533 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3053  hypothetical protein  25.62 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  26.23 
 
 		 516 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2442  hypothetical protein  25.95 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>