41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1021 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  44.72 
 
 		 295 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  46.33 
 
 		 298 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  46.12 
 
 		 318 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  39.32 
 
 		 304 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  45.34 
 
 		 331 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  41.75 
 
 		 310 aa  132  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  35.18 
 
 		 309 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  36.05 
 
 		 284 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  38.53 
 
 		 291 aa  85.9  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  34.57 
 
 		 281 aa  85.1  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  32.32 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  34.76 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  35.84 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  35.88 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  30.86 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  32.37 
 
 		 520 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  31.07 
 
 		 526 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  32.43 
 
 		 542 aa  68.2  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  34 
 
 		 312 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  29.45 
 
 		 516 aa  66.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  32.63 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  29.51 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  29.14 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  29.19 
 
 		 514 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  27.98 
 
 		 524 aa  59.7  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  27.38 
 
 		 534 aa  59.7  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  27.95 
 
 		 505 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  27.88 
 
 		 298 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  26.84 
 
 		 476 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  24.36 
 
 		 528 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  27.15 
 
 		 530 aa  49.7  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  27.33 
 
 		 515 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  24.14 
 
 		 497 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  23.81 
 
 		 536 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  29.25 
 
 		 358 aa  45.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  27.17 
 
 		 315 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2511  eight transmembrane protein EpsH  24.26 
 
 		 302 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3595  eight transmembrane protein EpsH  24.26 
 
 		 302 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  27.38 
 
 		 529 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  30.61 
 
 		 525 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>