55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2199 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  100 
 
 
277 aa  547  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  59.76 
 
 
281 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  56.57 
 
 
281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  59.3 
 
 
312 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  53.36 
 
 
284 aa  228  8e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  52.96 
 
 
309 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  53.23 
 
 
281 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  35.77 
 
 
526 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  32.94 
 
 
277 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  31.52 
 
 
285 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  34.57 
 
 
290 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  31.25 
 
 
520 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  33.46 
 
 
516 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  33.2 
 
 
505 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  31.71 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  30.77 
 
 
304 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  35.78 
 
 
529 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  29.13 
 
 
533 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  33.47 
 
 
310 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  32.44 
 
 
298 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  30.89 
 
 
514 aa  95.9  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  26.15 
 
 
534 aa  93.6  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  31.72 
 
 
318 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  35.75 
 
 
213 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  29.15 
 
 
528 aa  89.4  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  26.04 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  29.17 
 
 
522 aa  82  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  24.36 
 
 
536 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  27.89 
 
 
510 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  29.74 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  25.29 
 
 
524 aa  79.7  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  25.69 
 
 
515 aa  79.7  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  29.08 
 
 
530 aa  79  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  24.57 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  29.88 
 
 
523 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  31.88 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  25.2 
 
 
476 aa  68.9  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  27.78 
 
 
485 aa  63.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  23.17 
 
 
497 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  31.25 
 
 
358 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  30.9 
 
 
492 aa  57  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  26 
 
 
516 aa  55.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  25.27 
 
 
496 aa  50.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  21.18 
 
 
462 aa  49.3  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3885  hypothetical protein  31.85 
 
 
550 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.315929  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0825  RND family efflux transporter subunit MFP  24.71 
 
 
309 aa  46.2  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.687604  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2511  eight transmembrane protein EpsH  24.45 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  23.08 
 
 
542 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3595  eight transmembrane protein EpsH  24.45 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  24.58 
 
 
508 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1390  hypothetical protein  27.41 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.410056  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  30.07 
 
 
658 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2911  hypothetical protein  25.84 
 
 
306 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326024 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0448  hypothetical protein  27.78 
 
 
164 aa  42.7  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.608891  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2693  eight transmembrane protein EpsH  24.23 
 
 
297 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.609355  decreased coverage  0.00255345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>