22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2911 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2911  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  619  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0825  RND family efflux transporter subunit MFP  72.33 
 
 
309 aa  430  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.687604  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2693  eight transmembrane protein EpsH  55.17 
 
 
297 aa  336  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.609355  decreased coverage  0.00255345 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3595  eight transmembrane protein EpsH  57.55 
 
 
302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2511  eight transmembrane protein EpsH  57.55 
 
 
302 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  25.94 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  27.8 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  28.78 
 
 
510 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  27.44 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  27.68 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  22.95 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  24.9 
 
 
528 aa  48.9  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  27.27 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  28.57 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  24.69 
 
 
529 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  25.9 
 
 
315 aa  46.2  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  24.26 
 
 
536 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0021  hypothetical protein  26.55 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00770996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  26.76 
 
 
298 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3934  hypothetical protein  29.41 
 
 
279 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00016273  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  24.53 
 
 
515 aa  42.7  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  26.19 
 
 
485 aa  42.4  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>