20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_0825 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0825  RND family efflux transporter subunit MFP  100 
 
 
309 aa  624  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.687604  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2911  hypothetical protein  72.33 
 
 
306 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2693  eight transmembrane protein EpsH  56.27 
 
 
297 aa  331  7.000000000000001e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.609355  decreased coverage  0.00255345 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3595  eight transmembrane protein EpsH  61.26 
 
 
302 aa  319  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2511  eight transmembrane protein EpsH  61.26 
 
 
302 aa  318  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  27.06 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  28.78 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  29.9 
 
 
510 aa  62.8  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  29.74 
 
 
304 aa  59.7  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  29.69 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  25.52 
 
 
529 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  26.46 
 
 
298 aa  49.3  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  22.67 
 
 
290 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  26.36 
 
 
515 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  19.57 
 
 
514 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  24.55 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  25.5 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0021  hypothetical protein  28.18 
 
 
309 aa  42.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00770996  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  24.14 
 
 
277 aa  43.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  24.62 
 
 
536 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>