45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3270 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  100 
 
 
536 aa  1072    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  44.22 
 
 
528 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  39.88 
 
 
505 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  40.4 
 
 
529 aa  362  1e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  43.94 
 
 
530 aa  341  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  41.82 
 
 
524 aa  337  5e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  40.88 
 
 
515 aa  332  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  41.22 
 
 
514 aa  323  7e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  36.05 
 
 
510 aa  280  6e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  29.29 
 
 
497 aa  194  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  26.74 
 
 
476 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  30.06 
 
 
523 aa  188  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  30.13 
 
 
492 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  33.33 
 
 
485 aa  147  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  27.11 
 
 
522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  27.57 
 
 
525 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  27.84 
 
 
290 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  21.69 
 
 
508 aa  107  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  22.47 
 
 
520 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  29.89 
 
 
277 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  31.93 
 
 
285 aa  99.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  25.05 
 
 
526 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  25 
 
 
516 aa  96.3  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  20.56 
 
 
496 aa  91.3  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  29.46 
 
 
462 aa  88.2  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  28.51 
 
 
284 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  23.74 
 
 
533 aa  82.4  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  24.89 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  24.4 
 
 
516 aa  74.7  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  25.99 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  24.09 
 
 
277 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  24.19 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  26.37 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  27.46 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  22.12 
 
 
534 aa  62.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  21.59 
 
 
331 aa  62  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  25.1 
 
 
281 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  29.05 
 
 
298 aa  61.6  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  24.46 
 
 
298 aa  53.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  30.46 
 
 
295 aa  52  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  30.56 
 
 
658 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  31.88 
 
 
358 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  25 
 
 
213 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  25 
 
 
318 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2911  hypothetical protein  22.77 
 
 
306 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>